Laboratorium Alat dan Teknik Penangkapan Ikan merupakan laboratorium yang melakukan kajian mengenai alat dan teknik penangkapan ikan yang ada di Indonesia. Laboratorium ini juga melakukan berbagai kegiatan penelitian tentang alat-alat tangkap yang ramah lingkungan. Desain alat-alat tangkap untuk dikaji di laboratorium ini. Diharapkan dari laboratorium ini akan menghasilkan desain dan alat tangkap yang dapat digunakan di masyarakat dengan memperhatikan aspek keberlanjutan sumberdaya ikan. Laboratorium Alat dan Teknik Penangkapan menitik-beratkan penelitian pada pembuatan alat tangkap yang nilai produktivitasnya tinggi, murah, mampu menjaga kelestarian sumberdaya ikan serta teknik pengoperasiannya yang mudah. Alat tangkap dan sumberdaya ikan yang menjadi objek penelitian utama di laboratorium ini adalah purse seine, gillnet, bubu serta ikan pelagis seperti tongkol, tuna, tengiri, bawal, serta untuk rajungan dan lobster.
